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| Classement | équipe recevante | à l'extérieur | Premier tour | Second tour | » 1. Mi-temps | 2. Mi-temps |
| # | Équipe | M. | G. | N. | P. | Buts | Diff. | Pts. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
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FC St. Pauli | 34 | 16 | 12 | 6 | 31:19 | 12 | 60 |
| 2 |
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FC Schalke 04 | 34 | 15 | 12 | 7 | 25:18 | 7 | 57 |
| 3 |
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Hamburger SV | 34 | 15 | 10 | 9 | 32:18 | 14 | 55 |
| 4 |
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SC Paderborn 07 | 34 | 13 | 15 | 6 | 31:15 | 16 | 54 |
| 5 |
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SV Darmstadt 98 | 34 | 15 | 8 | 11 | 37:23 | 14 | 53 |
| 6 |
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1. FC Heidenheim 1846 | 34 | 11 | 18 | 5 | 18:11 | 7 | 51 |
| 7 |
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Fortuna Düsseldorf | 34 | 11 | 16 | 7 | 22:12 | 10 | 49 |
| 8 |
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Jahn Regensburg | 34 | 12 | 12 | 10 | 23:18 | 5 | 48 |
| 9 |
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1. FC Nürnberg | 34 | 11 | 14 | 9 | 19:22 | -3 | 47 |
| 10 |
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Werder Bremen | 34 | 9 | 15 | 10 | 18:19 | -1 | 42 |
| 11 |
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Karlsruher SC | 34 | 9 | 14 | 11 | 21:29 | -8 | 41 |
| 12 |
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Hansa Rostock | 34 | 9 | 13 | 12 | 20:22 | -2 | 40 |
| 13 |
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SV Sandhausen | 34 | 8 | 16 | 10 | 16:19 | -3 | 40 |
| 14 |
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Hannover 96 | 34 | 7 | 16 | 11 | 19:25 | -6 | 37 |
| 15 |
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Holstein Kiel | 34 | 8 | 11 | 15 | 20:30 | -10 | 35 |
| 16 |
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FC Ingolstadt 04 | 34 | 7 | 12 | 15 | 15:26 | -11 | 33 |
| 17 |
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Dynamo Dresden | 34 | 5 | 14 | 15 | 9:26 | -17 | 29 |
| 18 |
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Erzgebirge Aue | 34 | 4 | 14 | 16 | 10:34 | -24 | 26 |
| Promotion | |
| Relégation | |
| Relégation | |
| Relégation |
